Министарство сигурности Босне и Херцеговине надлежно је за:
- заштиту међународних граница, унутрашњих граничних пријелаза и регулисање промета на граничним пријелазима Босне и Херцеговине;
- спрјечавање и откривање учинилаца кривичних дјела тероризма, трговине дрогом, кривотворења домаће и стране валуте и трговине људима и других кривичних дјела са међународним или међуентитетским елементом;
- међународну сарадњу у свим областима из надлежности Министарства (сарадња са ИНТЕРПОЛ-ом, ЕУРОПОЛ-ом, СЕЛЕЦ, МАРРИ…);
- заштиту лица и објеката;
- прикупљање и кориштење података од значаја за сигурност Босне и Херцеговине;
- организацију и усаглашавање активности ентитетских министарстава унутрашњих послова и Брчко Дистрикта Босне и Херцеговине у остваривању сигурносних задатака у интересу Босне и Херцеговине;
- провођење међународних обавеза и сарадњу у провођењу цивилне заштите, координирање дјеловања ентитетских служби цивилне заштите у БиХ и усклађивање њихових планова за случај природне или друге несреће које захватају територију Босне и Херцеговине, и доношење програма и планова заштите и спашавања;
- Креира, стара се и проводи политику усељавања и азила у Босни и Херцеговини;
- Уређује процедуре и начин организације службе везано за кретање и боравак странаца у Босни и Херцеговини;
- пружање подршке полицијским тијелима Босне и Херцеговине;
- школовање и стручно усавршавање кадрова у складу с потребама полицијских тијела Босне и Херцеговине и других служби и агенција из области сигурности;
- форензичка испитивања и вјештачења.
У саставу овог министарства као управне организације су Дирекција за координацију полицијских тијела Босне и Херцеговине, Гранична полиција Босне и Херцеговине, Државна агенција за истраге и заштиту, Агенција за форензичка испитивања и вјештачења, Агенција за школовање и стручно усавршавање кадрова, Агенција за полицијску подршку и Служба за послове са странцима.